REALLY™ FOR RNA-SEQ
DIRECTIONAL LIBRARY PREP FROM TOTAL RNA
RNA-Seq의 보다 간단한 워크플로우를 소개합니다. first-strand cDNA 합성, 라이브러리 준비 및 리보디플리션으로 이어지며, 크게 손상된 input도 가능합니다. 두 번째 가닥을 생성하지 않기 때문에 방향성 정보를 보존하기 위한 추가적인 단계가 필요하지 않습니다.
rNONE®은 리보디플리션을 위한 streptavidin 기반의 워크플로우로, cDNA 합성 및 어댑터 연결 이후에 ribosomal RNA 및 기타 풍부한 ribonucleoprotein transcripts를 제거합니다. 이를 통해 안정하지 않은 RNA 처리 소요되는 시간을 줄이고, 디플리션된 또는 디플리션되지 않은 라이브러리로부터 downstream enrichment을 수행할 수 있는 옵션을 제공합니다.
PRODUCT SPECIFICATIONS
- 타사 RNA-Seq 프로토콜과 대비 3시간 이상의 프로토콜 시간 단축
- 손상된 샘플을 개선하기 위한 추가 모듈 필요 없음
- 10-250 ng의 input 범위
- 유전체 DNA의 흔적을 제거하기 위한 DNaseI 처리 모듈 선택 가능
- 첫 번째 단계에서 RNA가 cDNA로 전환되어, RNase에 노출 최소화
- 인간 및 쥐의 세포질 및 미토콘드리아 RNA의 강력한 rRNA 감소율 < 1%
- 과다 존재하는 작은 RNA인 RN7SL1 및 RN7SL2의 감소
- First-strand cDNA synthesis module
- SRSLY® Library Preparation Base Kit for adapter ligation and Index PCR
- rNONE™ – Ribodepletion module with rNONE purification beads
- Clarefy™ DNA purification beads
FOR WHAT REALLY?
APPLICATIONS
- Differential expression analyses module
- Novel RNA discovery
- Isoform analyses
- RNA-Seq from low inputs
SAMPLE TYPES
- Total RNA from cell-culture
- RNA from fresh frozen and FFPE tissues
HOW DOES REALLY COMPARE?
REALLY™ PERFORMANCE METRICS
REALLY libraries와 이중 가닥(double-stranded) library preparation 방법의 molecular metrics 비교. 입력으로는 Agilent Universal Total Human RNA control이 사용되었습니다.
REALLY libraries와 이중 가닥(double-stranded) library preparation 방법의 sequencing metrics 비교. 라이브러리는 NextSeq500에서 200M 이상의 리드(reads) depth로 시퀀싱되었습니다.
더 적은 양의 input으로 library prep을 진행할 수 있습니다. REALLY-rNONE은 넓은 입력 범위에서 더 높은 복잡성의 라이브러리를 생성합니다.
REALLY를 사용하여 더 나은 gene body coverage double-stranded Prep을 얻을 수 있습니다. transcripts의 보다 균일한 커버리지로 RNA isoforms의 정확한 평가가 가능합니다. Double-stranded 접근법은 5’ bias 입니다.
라이브러리 간 높은 concordance가 확인됩니다. REALLY-rNONE 라이브러리는 넓은 입력 범위에서 동등한 리드 카운트를 가졌습니다.
WHAT ABOUT POOR QUALITY SAMPLES?
